南科大位于深圳市南山區西麗大學城，校園占地面積近3000畝，規劃總建筑面積為90多萬平方米，分二期建設。目前二期建設已接近尾聲，建成后將滿足8000在校生的辦學需求。

南科大校園環境優美、交通便利，校園內九山一水，風景如畫。建筑彰顯“厚重、節能、實用、環保”理念，成為綠色建筑和生態校園的典范，已被公認為中國最美大學校園之一。