1993年，河北科技大學依托原有機化工專業設立了化學制藥專業。1998年，根據教育部專業目錄要求，將化學制藥專業調整為制藥工程專業，是全國首批設置制藥工程專業的30余所院校之一。經過20多年的發展，依托化學工程與技術、藥學兩個一級學科，以及國家級實驗教學示范中心和省部共建國家重點實驗室培育基地，制藥工程專業逐漸發展成為地方院校中實力最強的專業之一，并于2009年被教育部批準為國家級高等學校特色專業建設點，2013年入選第三批“卓越工程師教育培養計劃”試點專業，2016年向中國工程教育專業認證協會遞交認證申請并被受理。

制藥工程專業持續開展專業人才培養定位、課程體系、實踐教學、校企合作等方面的教學研究，獲得多項研究成果。“化工制藥類專業創新實踐平臺建設”榮獲2009年度河北省高等教育教學成果二等獎，“化工制藥類專業創新實踐教育體系的研究與實踐”獲2013年度河北省高等教育教學成果二等獎，核心課程《藥物合成反應》被評為國家精品課程，出版了配套教材《藥物合成反應基礎》；《波譜解析》為國家級雙語教學示范課程。申報教研課題10余項，發表教研論文9篇。學生的創新訓練特色突出，獲得“國藥工程杯”全國制藥工程設計大賽二等獎，全國大學生節能減排科技競賽、“挑戰杯”河北省大學生課外學術科技作品大賽等省級以上獎勵20多項。